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探針法熒光定量PCR試劑盒

探針法熒光定量PCR試劑盒

簡要描述:探針法熒光定量PCR試劑盒是使用探針法進行qPCR實驗的 即用型優(yōu)化預混液。兼容所有的qPCR檢測儀器,多種模板。探針法熒光定量PCR試劑盒使用時僅需加入模板、探針和引物即可進行實驗。

產(chǎn)品型號:

所屬分類:PCR試劑盒

更新時間:2024-12-31

詳細說明:

探針法熒光定量PCR試劑盒它具有下列特點:

 

1. 即開即用,用戶只需要提供樣品RNA模板。

 

 

2. 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性高。

 

 

3. 提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。

 

 

4. 特異性高,引物是根據(jù)小反芻獸疫病毒高度保守區(qū)設計,不會跟其他病毒的RNA發(fā)生交叉反應。

 

 

5. 本產(chǎn)品足夠 50 次 20μL 體系的探針法熒光定量 RT-PCR 反應。

 

 

6. 本產(chǎn)品只能用于科研。

 

 

 

 

 

規(guī)格及成分

 

 

 

成分

 

 

編號

 

 

十孔盒包裝

 

探針法 qRT-PCR 緩沖液

 

A

 

500μL(黃蓋)

 

探針法 qRT-PCR 酶混合液

 

B

 

100μL(紅蓋)

 

熒光 PCR 模板稀釋液

 

C

 

1 mL(黃蓋)

 

探針法 qRT-PCR引物混合液

 

D

 

100 μL(白蓋)

 

小反芻獸疫病毒 qRT-PCR 探針

 

E

 

50 μL(棕色管)

 

探針法 qRT-PCR陽性對照(1×10E8 拷貝/μL)

 

F

 

50 μL(黃蓋)

 

核酸釋釋劑(試用裝)

 

G

 

20 次(1mL,綠蓋)

 

使用手冊

 

H

 

一份

 

運輸及保存 低溫運輸,-20℃保存,保存期限為12個月。

 

 

探針法熒光定量PCR試劑盒自備試劑 :樣品 RNA。

 

 

使用方法

 

 

一、稀釋標準曲線樣品(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)。由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的 DNA 段作為陽性對照。

 

 

1. 標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。

 

 

2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 RT-PCR 模板稀釋液,用帶芯槍頭,下同)。

 

 

3. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。

 

 

4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。

 

 

5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。

 

 

6. 重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。

 

 

二、樣品 RNA 的制備

 

 

7. 如果有N個樣品,設置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是 NC(樣品制備陰性對照)。可以用10μL陽性對照的10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。

 

 

8. 用自選方法純化樣品的RNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒RNA提取試劑盒兼容。也以選購本公司的柱式病毒RNAout。本試劑盒免費贈送20次免RNA提取的核酸釋放劑試用裝,該釋放劑的裂解液可以直接作為RT-PCR模板,省略了RNA提取步驟。

 

 

三、Probe qRT-PCR 反應(20μL 體系,在樣品制備室進行)

 

 

9. 如果做定量分析并且只做1次重復,則標記N+9個PCR 管,其中N+2個用于上步得到的 N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),6個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復,則標記N+4 個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),1個用于PCR陽性對照(用第4號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。

 

 

10. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后加):

 

 

 

 

成分

 

 

樣品管N+2個

 

 

RT-PCR陰性對照管

 

 

標準曲線樣品管

 

 

(2-7 管)

 

探針法qPCR緩沖液

 

各 10 μL

 

10 μL

 

各 10 μL

 

探針法 qPCR 酶混合液

 

各 2 μL

 

2 μL

 

各 2 μL

 

qRT-PCR探針

 

各 1 μL

 

1 μL

 

各 1 μL

 

探針qRT-PCR

 

引物混合液

 

各 2 μL

 

 2 μL

 

各 2 μL

 

待測樣品 RNA 模板

 

各 5 μL

 

--

 

--

 

超純水

 

--

 

5 μL

 

--

 

第 7 步所得標準曲線樣品稀釋液(2-7 號)

 

--

 

--

 

各5 μL(2號樣到2號管,3號樣到3 號管…)

  • 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行 qRT-PCR:

 

 

過程

 

 

溫度

 

 

時間

 

逆轉(zhuǎn)錄

 

50℃

 

30 min

 

預變性

 

94℃

 

10 min

 

qRT-PCR 反應(40 個循環(huán))

 

94℃

 

15 sec

 

60℃

 

1 min(采集 FAM 通道的熒光信號)

 

五、數(shù)據(jù)處理

 

 

12. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品RNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。

 

 

13. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct 值應該小于或等于 30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復一次。重復實驗的 Ct值如果大于或等于 40 則為陰性,如果小于 35,則為陽性。

 

 

六、常見問題與解決方法:

 

 

 

常見問題

 

 

可能原因

 

 

解決方法

 

 

 

陽性對照、待測樣本均無條帶。

 

PCR反應體系或反應條件不合適。

 

使用梯度PCR摸索PCR反應條件。

 

PCR試劑保存不當失去活性。

 

2× PCR Mix應保存于-20℃,使用時避免反復凍融。若使用頻繁,可在4℃短時間存放。

 

引物設計問題。

 

嘗試重新設計引物進行檢查。

 

 

 

 

 

 

 

陽性對照有目的條帶,待測樣本無條帶或條帶弱。

 

不當儲存或長期儲存引起試劑活性喪失。

 

使用新鮮的試劑。

 

加入組織裂解液過量。

 

增大反應體系,或減少裂解液的用量。

 

樣本裂解混合液保存不當或保存時間過久,DNA基因組已經(jīng)降解。

 

裂解混合液液可在4℃保存2-3天,盡量使用新制備的裂解液混合液進行PCR。

 

模板加入量不適合。

 

在反應體系10-20%范圍內(nèi)優(yōu)化模板加入量。反應效性能較差時,可以降模板濃度調(diào)節(jié)到低于10%的范圍。

 

PCR循環(huán)數(shù)不足。

 

適當增加PCR的循環(huán)數(shù),推薦在35-40循環(huán)為佳。因為模板復雜,一般PCR反應要比用純化的 DNA模板多5-10個循環(huán)為佳。

 

 

 

 

非特異性擴增

 

PCR退火溫度太低,循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度太高。

 

增加PCR退火溫度,降低PCR循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度。

 

PCR引物錯配。

 

重新設計PCR引物。

 

配制PCR反應體系時溫度太高或配制完成后放置時間太久。

 

PCR反應體系的配制在低溫下進行,配制完成后盡快進行PCR擴增反應。

 

 

 

 

陰性對照出現(xiàn)目的條帶

 

操作工具或試劑污染。

 

實驗所有試劑或器材均應高壓滅菌。操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或濺出離心管外。

 

樣本間交叉污染。

 

每個取樣器只對一個樣本使用;或取完一個樣本后,將取樣器刃口浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復涮洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液。

 

 

 

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